Theologische Fakultät	seit 1990
Fakultät für Wirtschafts- und Rechtswissenschaft	1990-1991
Juristenfakultät	seit 1991
Wirtschaftswissenschaftliche Fakultät	seit 1991
Medizinische Fakultät	seit 1990
Fakultät für Philosophie und Geschichtswissenschaft	1990-1994
Fakultät für Kultur-, Sprach- und Erziehungswissenschaft	1990-1994
Fakultät für Geschichte, Kunst- und Orientwissenschaften	seit 1994
Philologische Fakultät	seit 1994
Erziehungswissenschaftliche Fakultät	seit 1994
Fakultät für Sozialwissenschaften und Philosophie	seit 1994
Fakultät für Mathematik und Naturwissenschaften	1990-1994
Fakultät für Mathematik und Informatik	seit 1994
Fakultät für Biowissenschaften, Pharmazie und Psychologie	seit 1994
Fakultät für Physik und Geowissenschaften	seit 1994
Fakultät für Chemie und Mineralogie	seit 1994
Sportwissenschaftliche Fakultät	seit 1991
Veterinärmedizinische Fakultät	seit 1990
Agrarwissenschaftliche Fakultät	1990-1993
Karl-Sudhoff-Institut	seit 1906